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大腸桿菌是第一個用于重組蛋白生產(chǎn)的宿主菌，它不僅具有遺傳背景清晰，培養(yǎng)操作簡單，轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)效率高，生長繁殖快，成本低廉，可快速大規(guī)模生產(chǎn)目的蛋白的優(yōu)點，而且其表達外源基因產(chǎn)物的水平遠遠高于其他基因表達系統(tǒng)，表達的目的蛋白量甚至能超過細菌中蛋白量的30%，因此大腸桿菌是目前應(yīng)用最廣泛的蛋白質(zhì)表達系統(tǒng)。但是也存在一些不足，比如目的蛋白常以包涵體形式表達，產(chǎn)物純化困難，且原核表達系統(tǒng)翻譯后加工修飾體系不完善，表達產(chǎn)物的生物活性較低等，同時基因的表達過程是一個復(fù)雜的過程，涉及基因的轉(zhuǎn)錄，翻譯，翻譯后加工，細胞的代謝以及細胞內(nèi)基因與蛋白，蛋白魚蛋白之間的互作等。

一個完整的原核表達系統(tǒng)通常包括配套的表達載體和表達菌株。如果是特殊的誘導(dǎo)表達還包括誘導(dǎo)劑，如果是融合表達還包括純化系統(tǒng)或者Tag檢測等等。選擇表達系統(tǒng)通常要根據(jù)實驗?zāi)康膩砜紤]，比如表達量高低，目標(biāo)蛋白的活性，表達產(chǎn)物的純化方法等等。